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APP备案和网站备案在本质上是一样的，都是针对提供非经营性互联网信息服务的网站或者APP进行备案登记。
根据《互联网信息服务管理办法》的规定，在中华人民共和国境内提供非经营性互联网信息服务的网站或者APP，应当办理备案手续。备案的目的主要是为了维护网络信息安全，保障互联网信息服务提供者和用户的合法权益，促进互联网信息服务健康有序发展。
APP备案和网站备案的管理机构也是相同的，都是国家互联网信息办公室。备案流程也基本一致，包括网上提交备案信息、提交相关材料、等待审核、领取备案号等步骤。
需要注意的是，APP备案和网站备案在某些方面也存在一些差异。比如，APP备案需要提供应用程序的基本信息，包括应用程序名称、类别、描述、开发商等；而网站备案则需要提供网站的基本信息，包括网站名称、域名、主办者信息等。APP备案和网站备案在备案时需要提交的材料也有所不同。
APP备案和网站备案在本质上是一致的，都是为了维护网络信息安全，保障互联网信息服务提供者和用户的合法权益。